漳泉移民曾在台湾总人口中占百分之八十二以上。不论是地缘血缘，都显得特别密切。文缘又同属中华文化，语言相通，风俗相同，物缘则物产基本一样，在神缘方面，两岸同胞共同信仰四大天神：妈祖、保生大帝、开漳圣王、关帝，闽南金三角与台湾的亲缘关纱是祖国其它地方难以比拟的。

在闽台四大天神中，吴真人崇拜，又因与民族英雄郑成功收复台湾，完成祖国统一大业的关系特别密切，因而具有特殊的重要意义。

明永历十五年（1661年）四月，郑成功率师收复台湾，白礁村有三百多名青壮年跟随郑氏东征，奉请保生大帝神像（二大帝）率先在台南头前寮将军溪畔登陆。台湾《南瀛文献》第27、28期合刊《头前寮将军溪畔“郑氏军民登陆遗址”》记址：因登陆之军民自大陆白礁迎请一尊保护神（二大帝）“保生大帝神像”，随同登陆，后来学甲建造慈济宫奉祀。为此学甲慈济宫信徒三百多年来在每年三月十一日，都在此举行上白礁谒祖典礼，往大陆白礁祭祖之意，面向大陆白礁遥拜祖先与祖庙。至此，吴真人崇拜的内容又进一步丰富和深化，他不仅是大陆人民心目中一位济世安民的理想神，而且是台湾同胞心目中一位激励忠贞爱国情怀的保护神，也就成为祖国之光，民族之魂和故乡之英。

三百多年来，学甲慈济宫，作为闽南移居台湾的开基祖庙，香火盛大，而一年一度的“上白礁谒祖祭典”规模更为盛大。这种谒祖寻根盛典，乃是“自古闽台一家人”的生动体现，不论是台湾人还是台湾神，他们的根都在大陆，真挚的家乡情、民族爱，塑造了闽台文化交流史上的一座丰碑。在台南学甲慈济宫前，有一付对联就是这样写着：

气壮乎天，万众同参学甲地；

血浓于水，千秋不忘白礁乡。

1978年10月25日，台胞于学甲镇西四公里处头前寮将军溪畔，建成一座高大的郑王军民登陆暨上白礁谒祖纪念碑。铭文曰：“三百余年来学甲地方及台湾各地信徒为遥拜大陆福建省白礁慈济宫——保生大帝祖庙，及追念大陆祖先，代代相传于每年三月十一日举么弘扬民族精神之上白礁谒祖祭典，而召闻遐迩。愿我们共同勤勉，使中华民族更发扬光大，千年万世永垂天地之间。”这座上白礁谒祖纪念碑，凝聚着台胞对闽台乃至整个祖国、民族的热爱和情思，寄托着他们强烈的爱国主义思想感情，已经超越对一般保护神的信仰。这种忠贞不渝的爱国情思，终于汇成民族利益高于一切的洪流，确实达到很高的思想境界，而这种爱我中华的民族精神，是具有永恒的价值。

从明永历十五年以来，台胞除了直接上白礁慈济祖宫谒祖进香而包，年年举办上白礁谒祖寻根盛典。尤其可贵的是，虽在日本占据时期的严禁压迫上也未曾中断，前几十年来，由于海峡阻隔，台胞难回大陆祖庙进香，追念怀思越久越浓，在学甲举行上白礁谒祖祭典的规模也愈来愈大。如1960年农历三月初九至十一日，台湾各地进香团自动聚来126队的民间艺阵及66顶神舆参加进香行列，排成长达10多公里的队伍，绕境游行三天共走完96公里。又如1982年4月4日，参加盛典的竟达10万人之众，一庙牵动万人心，十万台胞谒祖庭，诚可谓神州大地一大奇迹。

事实表明，由海峡两岸慈济宫所揭示的中华民族文化和增强民族团结有着稳固的知识。